آشنایی با نرم افزارها

نوامبر 10, 2022دسامبر 22, 2025PartPorsaدیدگاهی بنویسید

Only administrators can add new users.

آشنایی با نرم افزارها

نرم افزارها
- نرم افزارهای دینامیک مولکولی
  - لمپس
    - پک مول
    - طرز ساخت فایل ورودی
    - پارامترهای دینامیک مولکولی (فورٍث فیلد)
    - محاسبه ویسکوزیته با لمپس
    - جدول تناوبی
  - دی ال پولی
  - MDynaMix: a Molecular Dynamics Program
  - گرومکس
    - Molecular Dynamics on GPU – Gromacs in Google Colab
    - Molecular Dynamics in Gromacs and Jupyter Notebook
    - آموزش رایگان شبیه سازی دینامیک پروتئین با گرومکس
    - لینک سایت MMPBSA in Gromacs: ΔG Binding Free Energy Calculations
    - لینک فیلم MMPBSA in Gromacs: ΔG Binding Free Energy Calculations
    - ساخت ورودی گرمکس با ATB
      - وب سایت و مقاله
      - gromos54a7_atb.ff.tar
  - UnityMol: interactive and ludic visual manipulation of
    coarse-grained RNA and other biomolecules
- نرم افزارهای مکانیک کوانتومی
  - گوسین
  - COSMO-RS
  - هایپرکم
  - CPMD
  - multiwfn
    - Multiwfn: A multifunctional wavefunction analyzer
    - A comprehensive electron wavefunction analysis toolbox for chemists, Multiwfn
  - کوانتوم اسپرسو
  - نرم افزار open mx
  - TERACHEM برای محاسبه فشار XP-PCM
    - محاسبه اثر فشار در مکانیک کوانتوم XP-PCM
  - کوانتوم وایز
  - متریال استودیو materials studio
    - - نصب متریال استودیو
      - نصب متریال استودیو ویدئو
      - Adsorption of CO onto a Pd(110) surface
      - sorbtion isotherm of methane on ABW Zeolite by material studio 1
      - sorbtion isotherm of methane on ABW Zeolite by material studio 2
      - محاسبات الکترونیک و نمودار جریان ولتاژ
    - جذب آب در سلولز
    - بررسی بنتونیت BIOVIA MATERIALS STUDIO GULP
    - General Utility Lattice Program
    - DMol3
    - Castep
    - compass
    - QTAIM
- نرم افزارهای گرافیک مولکولی
  - دی اس ویژوالیزر
  - VMD
  - Ovito
  - Molegro
  - آووگادرو
  - رسم مولکول در وب و خروجی mol و sdf
  - رسم مولکول در جاوا اسکریپت با Jsmol Marvin and
  - رسم مولکول با chemdraw و خروجی گرفتن به فرمت sdf و MOL
  - رسم ظروف آزمایشگاهی chemix
- نرم افزارهای ریاضی
  - matlab
    - رسم ارببتالها با متلب
    - ساخت اپلیکیشن ویندوز با guide
      - mfile
      - fig
    - ljg
  - متلب در شیمی
  - small basic
- نرم افزارهای الکترونیک
  - آردوینو
  - altium designer
  - fritzing
- کد محاسبات توصیف کننده مولکولی با پایتون
  - DOPtools: a Python platform for descriptor calculation and model optimization
- نرم افزارهای طراحی دارو
  - Dragon
    - Molecular Descriptors Guide
    - نرم افزار
  - اتوداک
  - غربال گری مجازی با پایتون
    - فایل های محاسباتی
  - iGEMDOCK 2.1 program
  - The Surflex-Dock module in SYBYL
  - Using the pKCSM online tool, the ADMET properties of compounds were predicted
  - Desmond is a software package developed by Schrödinger for MD simulations of biological systems, including proteins, nucleic acids, and membranes.
  - DrugBank (www.drugbank.ca)
  - PyL3dMD: Python LAMMPS 3D molecular
    descriptors package
- سایت های طراحی دارو
  - SwissADME
  - Seven sequence-based predictive tools (SIFT, PANTHER, SNP&GO,
    Fathmm, PhD-SNP, SNAP, MetaSNP)
  - five structure-based tools (I-Mutant, DynaMut,
    CupSAT, muPRO, iStable)
  - pharmit
  - فیلم آموزشی فارمیت
  - pdb to smiles
  - گرومکس
  - شرودینگر
    - Schrödinger Software Release 2014-2 manual installing linux
      
      Beginning with Maestro Schrödinger Software Release 2014-3
      
      maestro_intro
      - کتاب آموزشی
    - کارگاه آموزشی
- اسکرچ
- sketch
- HX 8.0
- TeraChem
  - A graphical processing unit-accelerated electronic structure package for large-scale ab initio molecular dynamics
- KSSOLV 2.0 An efficient MATLAB toolbox for solving the Kohn-Sham
- نرم افزار فتوشاپ
  - نحوه نوشتن متن به شکل دایره ای در فتوشاپ
  - فوتوشاپ آنلاین
  - رسم مولکول آنلاین
    - PubChem Sketcher V2.4
  - رسم مولکول های آلی برای مقاله ACD/Chem Scetch
اکسل
- کاربرد در طیف سنجی
  - - نمودار فرترت

ارسال پاسخ رد پاسخ